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配列検索・解析等のサービスを提供している代表的なＷＷＷサイト

【国内】

1. GenomeNet (http://www.genome.ad.jp/)
   • 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンターのサービス
   • 関連する全て（？）のデータベースが検索できます
2. DDBJ (http://www.ddbj.nig.ac.jp/)
   DNA Data Bank of Japan （国立遺伝学研究所　日本DNAデータバンク）
   • DDBJ 構築サイト（EMBL/GenBank と共同でデータベースを構築し、世界に提供。）
   • データベースについて知るために一度は訪れたいサイト
   • DDBJ/EMBL/GenBank への配列登録はここから
3. NIAS DNA BANK (http://www.dna.affrc.go.jp/)
   
   • 農林水産省農業生物資源研究所（つくば）によるサービス
   • イネ、家畜、カイコのゲノム情報に強い
4. PRF (http://www.prf.or.jp/)
   Protein Research Foundation
   • （財）蛋白質研究奨励会によるサービス（ゲストには制限有り）
   • アミノ酸配列データベース (PRF/SEQDB) と関連文献データベース (PRF/LITDB)

【国外】

1. NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
   National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, NIH, USA
   • GenBank, PubMed 構築サイト
   • NIH, USA (https://www.nih.gov/) には、NCBI 以外にも多くのサーバーがあります。
2. EBI (http://www.ebi.ac.uk/index.html)
   European Bioinformatics Institute, outstation of EMBL
   • EMBL, Swiss-prot 等の構築サイト
3. ExPASy (http://www.expasy.org/) (Expert Protein Analysis System) proteomics server of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
   • Swiss-prot, Prosite, ENZYME, Swiss-2DPAGE 等の構築サイト
     
   • トップページの“Visual Guidance" や "Categories" 等のメニューが、データベースや解析ツール検索に有用！
   • （かつての Life Science Directory (formerly Amos' WWW links page) は、現在は更新されていない。）
4. PIR (http://pir.georgetown.edu/)
   Protein Information Resource
   • PIR-PSD (PIR Protein Sequence Database) 構築サイト
   • 2002 以降、上の EBI, ExPASy と共同で PIR-PSD, TrEMBLE, Swiss-Prot を統合した
     UniProt (http://www.uniprot.org/) を構築し、それに基づいた分類、機能、文献情報などを提供
5. RCSB-PDB (http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)
   Protein Data Bank, Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB)
   • PDB（主に蛋白質の三次構造データベース）構築サイト（PDBj: PDB Japan も協力）
   • データ登録と検索は国内サイトの「PDBj: PDB Japan」から
     （サボート：阪大蛋白研，バイオサイエンスデータベースセンター）

補足

1. 何れのサイトにも別の多くのサイトへのリンク情報が在ります。
2. URL（アドレス）は 2016年12月現在です。変更されることもあります。
3. 新規配列のホモロジー検索の際には、セキュリティーの問題にも留意して下さい。